Dans un rapport sur FranceAgriMer paru le 16 mars, la Cour des comptes constate que l’établissement public « rencontre des difficultés » pour gérer les dispositifs nationaux « complexes et sélectifs » financés par le fonds Casdar (développement agricole), les programmes d’investissement d’avenir (PIA) ou France 2030, « faute d’expertises internes, d’indicateurs de performance et d’impact nécessaires à leur suivi ». Les auteurs proposent de « confier à un autre organisme la gestion des dispositifs financés par le Casdar ».